El logo de la UMSA es identificado fácilmente por la comunidad universitaria y ciudadanía en General por el reconocimiento y prestigio que tiene esta Universidad en Bolivia. La imagen del logo de la Universidad Mayor de San Andŕes está presente en cada documento que fue generado en esta Universidad, ya sean Tesis, Proyectos de Grado, Monografías y otros documentos institucionales de la UMSA.
El escudo de la Universidad Mayor de San Andrés está constituido por un óvalo central con bordes dorados y fondo azul que contienen las palabras»Universitas Major Pacensis Divi Andre AE». En el interior del óvalo se encuentra la montaña del Illimani ubicada en la Ciudad de La Paz, sobre ella un sol radiante. En la parte inferior se encuentra una rama con un sable sobre un libro.